Za účelem podpory vědců v oblasti životního prostředí při hledání „přiměřeného“ modelu systému, který zkoumají, je nezbytný počítačový program, který umožní jeho uživatelům provádět simulace pomocí různých modelů, posoudit identifikovatelnost a odhadnout hodnoty parametrů modelu (pomocí naměřených dat) a odhadnout nejistotu predikce.Počítačový program AQUASIM byl vyvinut pro provádění těchto analýz pro technické a přírodní vodní systémy.AQUASIM umožňuje svým uživatelům definovat prostorovou konfiguraci systému, který má být zkoumán, jako soubor oddílů, které lze vzájemně propojit pomocí odkazů.Dostupné typy kompartmentů v současné době zahrnují smíšené reaktory, biofilmové reaktory (skládající se z biofilmu a objemové kapalné fáze), reaktory s orientační difuzí (reaktory s uzávěrovým tokem s disperzí nebo bez disperze), nasycené kolony půdy (se sorpcí a výměnou objemu pórů),říční úseky (popisující vodní tok a transport a transformaci látek v otevřených kanálech) a jezera (popisující stratifikaci a transport a transformaci látek ve vodním sloupci jezera a v sousedních vrstvách sedimentu).Přihrádky lze propojit dvěma typy vazeb (jezera zatím nelze propojit s jinými přihrádkami).Užitečná propojení představují tok vody a vhodný transport látek mezi oddíly, včetně rozdvojení a křižovatek.Difuzní vazby představují mezní vrstvy nebo membrány, které mohou selektivně pronikat určité látky.Uživatel programu může libovolně určovat jakoukoli sadu stavových proměnných a transformačních procesů, aby byly aktivní v kompartmentech.Pro model definovaný uživatelem je program schopen provádět simulace, analýzy citlivosti a odhady parametrů pomocí naměřených dat.Díky těmto vlastnostem je program velmi užitečným výzkumným nástrojem.Vypočítané výsledky mohou být vykresleny na obrazovku (pouze verze rozhraní okna), zapsány do souboru Post-Script pro přenos do tiskárny ......