MSYS je kolekce GNU nástrojů, jako jsou bash, make, gawk a grep, které umožňují vytváření aplikací a programů, které závisí na tradičně používaných nástrojích UNIX.Účelem je doplnit MinGW a nedostatky skořápky cmd.Příkladem by bylo vytvoření knihovny, která používá systém sestavování autotoolů.Uživatelé obvykle spouští „./configure“ a poté „make“, aby jej vytvořili.Skript pro konfiguraci shellu vyžaduje interpret skriptů, který není přítomen v systémech Windows, ale poskytuje ho MSYS ....