Cytoscape

Cytoscape je softwarová platforma s otevřeným zdrojovým kódem pro vizualizaci složitých sítí a jejich integraci s jakýmkoli typem dat atributů.

Zdarma
Windows
Mac
Linux

Cytoscape je softwarová platforma s otevřeným zdrojovým kódem pro vizualizaci složitých sítí a jejich integraci s jakýmkoli typem dat atributů.Mnoho doplňků je k dispozici pro různé druhy problémových domén, včetně bioinformatiky, analýzy sociálních sítí a sémantického webu.Cytoscape podporuje mnoho případů použití v molekulární a systémové biologii, genomice a proteomice: Načtěte soubory dat o molekulární a genetické interakci v mnoha formátech Projděte a integrujte globální datové sady a funkční anotace. Vytvořte výkonné vizuální mapování napříč těmito daty. Proveďte pokročilé analýzy a modelování pomocí modulů Cytoscape.a analyzovat datové sady o trase člověka, jako je Reactome nebo KEGG.

Alternativy Cytoscape pro všechny platformy s jakoukoli licencí

Polinode

Polinode je nástroj, který usnadňuje výkonnou analýzu sítě.Před analýzou a vizualizací sítí můžete nahrát svá vlastní síťová data nebo použít integrovaný nástroj průzkumu založeného na vztazích.